次々に狙われるコナンの仲間たち…
犯行現場に残されたトランプの謎を解き明かせ！

劇場版名探偵コナン最新作『隻眼の残像（フラッシュバック）』の公開を記念して3週連続で人気の劇場版を放送！第1夜は1998年公開のシリーズ第2弾！目暮警部が何者かにボウガンで狙撃される事件が発生。さらに蘭の母、妃英理、阿笠博士と相次いで命を狙われる。小五郎と親しい人物が標的にされたことから、犯人は小五郎に恨みをもつ者と思われるが……。犯行現場に残されたトランプの意味、そして犯人の連続襲撃事件の狙いとは何なのか？警官として将来を有望視されていた小五郎が警察を辞めた理由や妻・妃英理と別居することになった経緯など小五郎の秘められた過去が明かされる！！

別居中の母・妃英理（高島雅羅）と久しぶりに食事に行くことになった蘭（山崎和佳奈）と小五郎（神谷明）、そしてコナン（高山みなみ）。小五郎と馴染みの深いソムリエ、沢木公平（中尾隆聖）のエスコートのお陰で和気あいあいと食事は進むが、小五郎がうっかり他の女性に目をやったせいで、英理は大激怒。食事は物別れに終わってしまう。
それから一週間後。ジョギング中の目暮警部（茶風林）がボウガンで撃たれる事件が発生。その直後、オフィスに届けられた毒入りチョコを食べた英理が突然苦しみはじめ…。それぞれの現場に紙製の洋剣と花が残されていたことから、警察は同一犯の犯行と断定。そんな中、今度はコナンの目の前で阿笠博士（緒方賢一）がボウガンで撃たれた!!コナンは犯人を追いつめるが、あと少しのところで取り逃がしてしまう。

しかし博士が撃たれた現場の遺留品から、コナンは犯人の狙いを見抜いた！犯人は被害者の名前をトランプの数字や絵札になぞらえて、犯行を重ねていたのだ。被害者が全員小五郎と関係があること、名前に入っている数字がキング＝13、クイーン＝12、ジャック＝11とカウントダウンしていることから、次は小五郎の知り合いで名前に10を含む人が狙われるのではないかとコナンは推理するが…。