ストーリー
イーサン・ハントが自らの過去を知る敵と対峙する!

最新鋭のAIシステムを搭載したロシアの潜水艦が、自らが発射した魚雷の直撃によって沈没する。そんな中、アムステルダムにいたIMFのイーサン・ハント(トム・クルーズ)のもとに、元MI6のイルサ・ファウスト(レベッカ・ファーガソン)を見つけ出し、彼女が持ち出した「鍵」を奪い返せという任務が届く。イルサを追いアラビアの砂漠へ向かったイーサンは、彼女から「鍵」を手に入れるが、その「鍵」は世界中のシステムから情報を得ることが可能な高度なAI「エンティティ」を動かすことのできるものだった。自らの意思を持ち、世界を滅ぼす兵器ともなりうるエンティティを手に入れれば、世界中を支配することが可能になる…。

世界各国が「鍵」を手に入れようと奔走していることを知ったイーサンは、仲間のベンジー(サイモン・ペッグ)とルーサー(ヴィング・レイムス)の協力を仰ぎ、もう1本の「鍵」を手に入れエンティティを無力化するためのミッションに挑む。しかしそれは、アメリカだけでなく、世界中の権力者を敵に回すことを意味していた…。
鍵を持つ男性を追うイーサンは、突然現れたスリの達人グレース(ヘイリー・アトウェル)によって「鍵」を盗まれてしまう。彼女を追いローマへ向かったイーサンの前に現れたのは、かつて因縁のあった男ガブリエル(イーサイ・モラレス)。果たしてイーサンは、エンティティの暴走を止めることができるのか!?